Le Border est composé d’un QG aux quels sont rattachées les principales unités, et de quelques sections ou branches spécialisées.
Les unités sont classées selon des rangs : C (les recrues), B (la force principale) et A (les unités d’élite). Plus les agents de rang S qui utilisent des Black Triggers.
Les meilleurs unités de rangs A participent aux missions d’explorations d’au-delà la Frontière.

Il existe un système de classement des unités avec des points. On obtient des points via des missions, mais le plus efficace pour monter c’est lors des Guerres de Rangs. Ce sont des compétitions entre les unités qui permettent de maintenir les rivalités et l’envie d’être les meilleurs.

La Branche Tamakoma

Une petite section composée de deux unités, Tamakoma-1 et Tamakoma-2 (les héros). Ils développent des Triggers expérimentaux et ne considèrent pas que les Frontaliers soient nécessairement tous des ennemis.

Boss : Takumi Rindo

La Faction Shinoda

Ils n’ont pas d’haine particulière contre les Frontaliers. Ils ne s’intéressent qu’à la défense de la ville.

Boss : Masafumi Shinoda

La Faction Kido

Ils détestent les Frontaliers ou tout du moins considèrent que tout Frontalier est un ennemi à abattre.

Boss : Masamune Kido